InterSynergy partnerem technologicznym Hackatonu BioNinja Challenge 2019
Organizatorem hackatonu BioNinja Challenge w 2019 była Pracownia Biobank Uniwersytetu Łódzkiego. Wyzwanie połączyło biologów, informatyków i bioinformatyków - osoby z różnych środowisk - do pracy nad rozwiązaniem problemów współczesnej genetyki. W konkursie wzięło udział 30 osób z Polski i Ukrainy, tworząc kilkuosobowe zespoły. W ciągu 24 godzin każdy z zespołów musiał wymyślić odpowiedź na jedno z trzech zadań:
- poszukiwanie peptydów o właściwościach przeciwdrobnoustrojowych, które mogłyby stanowić ewentualny zamiennik dla tradycyjnych antybiotyków;
- opracowanie oprogramowania wspomagającego sekwencjonowanie DNA następnej generacji;
- wytworzenie modeli predykcji szans na wystąpienie otyłości na podstawie sekwencji DNA i danych fenotypowych;
W InterSynergy jesteśmy zachwyceni, że mogliśmy udzielić pomocy Pracowni Biobanku Uniwersytetu Łódzkiego. Jest to kolejny przypadek, w którym spełniliśmy nasz cel, jakim jest pomoc entuzjastom technologii w osiąganiu ich celów.
Zwycięzcą projektu została grupa Grumpy Hackers (studenci i doktoranci Uniwersytetu Warszawskiego), która wystartowała z projektem, wykorzystującym sztuczną inteligencję do poszukiwania peptydów o właściwościach antybakteryjnych jako potencjalnych zamienników antybiotyków. Program może mieć zastosowanie w nauce i medycynie.
Grupa "Slavic" z Białegostoku, triumfująca w ubiegłorocznym biohackathonie, zdobyła drugie miejsce w konkursie, proponując rozwiązanie z zakresu wyszukiwania peptydów. Podium uzupełnił zespół KÖMPILATOR złożony ze studentów informatyki i bioinżynierii studiujących na Politechnice Wrocławskiej, który rozwiązał problem optymalnego doboru indeksu dla sekwencjonowania następnej generacji.
Tegoroczna edycja Hackathonu została włączona w poczet imprez tworzących CodeWeekEU oraz Festiwalu Cyfryzacji. Organizator imprezy - Pracownia Biobank Uniwersytetu Łódzkiego, od roku 2016 promuje Uniwersytet Łódzki, będąc członkiem dwóch europejskich, prestiżowych organizacji zrzeszających jednostki biobankujące: BCNet (Biobank and Cohort Building Network) oraz ESBB (European and Middle Eastern Society for Biopreservation and Biobanking). Jednostka należy do krajowego Konsorcjum BBMRI.pl, realizującego projekt na rzecz Infrastruktury Badawczej Biobanków i Zasobów Biomolekularnych BBMRI-ERIC (Biobanking and BioMolecular resource Research Infrastructure - European Research Infrastructure Consortium), współtworząc Polską Sieć Biobanków.
Patronat nad wydarzeniem objęli: Hanna Zdanowska-Prezydent Miasta Łodzi, Jarosław Gowin Minister Nauki i Szkolnictwa Wyższego oraz Ministerstwo Cyfryzacji
Partner: Polskie Towarzystwo Bioinformatyczne.
Partnerzy technologiczni wydarzenia: InterSynergy Software House i Agencja Kreatywna Onespark
Partnerzy medialni: biotechnologia.pl, dlastudenta.pl, biostrefa.net, bulldogjob.pl
